El clarificador secundario tiene como papel principal separar la biomasa generada en el tratamiento secundario del agua tratada, produciendo un efluente clarificado con bajo contenido de sólidos suspendidos totales y carga orgánica. Asimismo, se utilizan los clarificadores secundarios en procesos que utilicen lodos activados, en donde se encargan de producir una concentración alta de sólidos en el fondo, para así recolectarla y retornarla al tanque de aireación, logrando que se mantenga una concentración adecuada de biomasa en los reactores